玉树市区海拔4493.4米。

玉树市位于青海省的西南部，地处青藏高原东部，位于玉树藏族自治州最东部，境内平均海拔4493.4米，地形以山地高原为主，通天河、扎曲、巴曲在玉树市境内流过。气候寒冷，年温差小，日温差大，是一个以牧为主，农牧结合的半农半牧城市。

最高山峰保俊色海拔5752米，东部正达金沙江水面海拔3350米，平均海拔4493.4米，境内海拔5000米以上的山峰有951座，大部分终年积雪。

地形地势东临川西山地，南接横断山脉北段，西近高原主体，地势高耸，地形复杂，由唐古拉山余脉色吉嘎牙—格拉山构成地形骨干，从东向西横贯县境中部，蜿蜒曲折，形成树枝形山地，是两大流域的分水岭。