基因突变和染色体变异是不一样的，它们还是有不同的差别的，基因突变是基因在结构上发生碱基对组成或排列顺序的改变。染色体变异是当染色体的数目发生改变，或者染色体的结构发生改变时，遗传信息就随之改变，带来的就是生物体的后代性状的改变。

基因突变和变异的区别：

1、基因突变是染色体上某一位点基因上碱基的而改变，突变的结果是产生了新的基因（等位基因）最肯恩过的发生时期是DNA的复制期：有丝分裂和减数分裂的间期

2、基因重组也就是基因变异是原有基因的重新组合，并没有产生新基因，而是产生了新的基因型基因重组发生的时期是：减数分裂中四分体时期同源染色体的非姐妹染色单体之间。