1、表面的皮肤不同：淡墨鱼表面皮肤光滑，没什么杂质，而海水墨鱼表面有白色盐晶。

2、生存环境不同：淡水墨鱼生活在淡水环境中，海水墨鱼生活在咸水环境中。

3、营养价值不同：相比较来说海水墨鱼的营养价值比淡水墨鱼的营养价值高。

4、淡干墨鱼在晾晒过程没有加盐腌制的墨鱼干，而海水墨鱼就是在晾晒过程中加盐腌制的墨鱼干。

5、淡干墨鱼没有加入食盐，这种墨鱼干手感比较轻，表面比较光滑，吃起来带有墨鱼的纯正鲜香原味。海水墨鱼在晾晒过程中要添加大量食盐进行腌渍，最后得到的墨鱼干含有较多盐分。手感较重，而且表面会有明显的盐渍，这种墨鱼干的咸度较大，食用之前必须反复浸泡漂洗，将过重的咸味稀释后才能食用。

6、从保质期的长短上来说，淡干墨鱼的保质期比较短，而海水墨鱼的保质期相对来说较长些。但无论是淡干墨鱼或海水墨鱼，晾晒结束后都必须密封起来冷冻保存，否则都容易变质。