菏泽市牡丹区共有18个街道，分别是东城街道、西城街道、程楠街道、北城街道、牡丹区街道、贺楼街道、黄镇街道、沙土镇、吴店镇、王浩屯镇、黄湾镇、都司镇、高庄镇、小刘镇、李村镇、安兴镇、大黄镇、姬胡镇。牡丹区，隶属于山东省菏泽市，位于山东省西南部，黄河下游南岸，北临鄄城，东接郓城、巨野，南接定陶、曹西安，西接东明，西北角黄河，与河南省濮阳市隔江相望。

牡丹区是菏泽市中心主城区，是著名的中国牡丹之都和书画之乡、戏曲之乡、曲艺之乡、武术之乡、民间艺术之乡。牡丹是牡丹区的特色产业，拥有九大色系、十大花型、1237个品种，是世界上最大的牡丹栽培、观赏、研发和苗木输出基地。

牡丹区是中华文明的重要发祥地，传说是伏羲之桑梓，尧舜之故里，素有“天下之中”之称。战国时期孙膑在此创下了“围魏救赵”的光辉战例；黄巢从这里高举义旗，踏上了推翻唐王朝的征程；刘邓大军在这里发起了鲁西南战役。这里还是抗日名将赵登禹、著名爱国人士何思源的家乡。